Hubungan diplomatik RI-Jepang telah berlangsung selama 62 tahun sejak 20 Januari 1958 dan diratifikasi pada April 1958. Sekarang, Indonesia dan Jepang menjalin Strategic Partnernship for Peaceful and Prosperous Future sejak November 2006. Partnership ini mencakup berbagai bidang termasuk investasi, perdagangan, dan pembangunan.